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吉尔伯特综合征的主要病因是肝细胞间接胆红素摄取障碍，肝细胞葡萄糖醛酸酶活性不足，白蛋白分离障碍与间接胆红素结合，导致血中间接胆红素升高。精神紧张、疲劳、感冒、感染等。都是诱发因素，会加重黄疸。
1.主要原因
现在认为这种疾病是由许多因素引起的：
1.肝脏胆红素葡萄糖醛酸转移酶先天缺陷可引起疾病，肝细胞内游离胆红素难以排泄到胆汁中，导致血液中游离胆红素增加。然而，未结合(间接)胆红素与葡萄糖醛酸的结合并不妨碍。
2.肝细胞的胆红素摄入异常，或胆红素到达肝细胞内结合部位(微粒体)前的转运过程受阻。
3.有人认为，肝细胞内胆红素的携带者是Y蛋白和Z蛋白，由于缺乏这两种蛋白而具有先天致病性。
2.诱发因素
疲劳、精神紧张、压力大、感染、饮酒、感冒是本病的诱发因素。可加重肝脏负担，降低肝细胞合成功能，进一步增加血液中的间接胆红素。诱因消除后，胆红素水平可降低。
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